libmove3d  3.13.0
/home/slemaign/softs-local/BioMove3D-git/bio/BioEnergy/include/bio_2amber.h
00001 #ifndef BIO_2AMBER_H
00002 #define BIO_2AMBER_H
00003 
00004 
00005 /* amber */
00006 #include <basics.h>
00007 #include <stringExtra.h>
00008 #include <vector.h>
00009 #include <matrix.h>
00010 #include <classes.h>
00011 #include <dictionary.h>
00012 #include <database.h>
00013 #include <library.h>
00014 #include <parmLib.h>
00015 #include <pdbFile.h>
00016 #include <help.h>
00017 #include <parser.h>
00018 #include <tools.h>
00019 #include <amber.h>
00020 #include <commands.h>
00021 #include <defaults.h>
00022 #include <leap.h>
00023 #include <octree.h>
00024 #include <tripos.h>
00025 #include <block.h>
00026 #include <leap.h>
00027 #include <getline.h> 
00028 
00029 
00030 
00031 
00032 void AMBER_addPath( STRING dir_name );
00033 OBJEKT AMBER_add_source(char *filename);
00034 OBJEKT AMBER_loadPdb(  FILE *fPdb);
00035 OBJEKT AMBER_loadPrep(char*file_prep);
00036 OBJEKT AMBER_loadMol2( char *mol2FileName );
00037 OBJEKT AMBER_loadParams(char *frcmod);
00038 void AMBER_saveParm(UNIT    uUnit,char *name_first );
00039 void AMBER_savePdbInGivenFile( OBJEKT objProt, FILE *fOut);
00040 void AMBER_savePdb( OBJEKT objProt, char *name_first);
00041 OBJEKT AMBER_Combine(OBJEKT  objProt, OBJEKT objLig);
00042 
00043 #endif /* #ifndef BIO_2AMBER_H */
 All Classes Files Functions Variables Typedefs Enumerations Enumerator Friends Defines